Kalküta yakınlarındaki bir köyde dünyaya geldi. Önce Kalküta Üniversitesi’nde okudu. Ardından eğitimine Japonya’da devam etti. Orada kısa bir süre kaldıktan sonra bir gemiyle Amerika’ya gitti. Stanford Üniversitesi’nde felsefe eğitimi aldı. İlk edebi yazılarını burada yazmaya başladı. İlk kitabı Fil Kari yayınlandığı anda büyük ilgi gördü. Diğer kitapları da onu izledi. Amerikan’ın en prestijli edebiyat ödüllerinden biri olan Newbery Madalyasını kazandı. Mukerji, kitaplarında genellikle orman yaşamı ve insan-hayvan dostluğu temasını işler ve okurunu, çocukluğunu geçirdiği muhteşem tropikal ormanlara götürür.